F.m بسیاری از سیانوباکترها می توانند نیتروژن و کربن دی اسید را تحت شرایط هوازی احیا نموده . فتوسنتز همراه با اکسایش آب ازتجمیع فعالیت های فتوسیستم II و I به انجام می رسد. در شرایط بی هوازی آنها می توانند از فتوسیستم I به تنهایی استفاده کنند که اهداکننده الکترون به جای آب دراینجا سولفید هیدروژن، هیدروژن مولکولی است؛ درست مثل باکتریهای فتوسنتز کننده ارغوانی.